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现代农业科技2018年第2期  文章正文

木本油料文冠果APETALA2基因全长cDNA序列与生物信息学分析

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  摘要 文冠果是我国北方特有的木本油料树种。ap2是植物种子发育调控的重要转录因子。根据已获得的文冠果转录组数据搜索文冠果ap2基因序列(xsap2),并对xsap2基因全长cdna序列进行生物信息学分析。结果表明,xsap2基因cdna序列包含1个长度为1 548 bp的完整orf,编码515个氨基酸。xsap2蛋白大部分区域为亲水区,由136个ɑ螺旋、89个延伸链、43个β-转角、247个无规则卷曲构成。依据2gcc.1.a同源建模法,获得1个三级结构模型,该模型从第153个氨基酸开始到第213个氨基酸结束。xsap2蛋白与9种其他植物ap2蛋白的同源性分析显示,文冠果ap2与可 ……阅读全文

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